Program Binaqu
Tahfidz Qur'an
Di program Binaqu, santri memang difokuskan untuk menghafal Al-Qur'an dengan target selama 3 tahun; santri mampu menghafal 30 juz Al-Qur'an secara lancar. Program ini dikhususkan untuk santri laki-laki usia 19–30 tahun yang belum menikah, karena dengan waktu yang hanya 3 tahun, santri akan digembleng fokus untuk bisa menghafal dan mempelajari isi dari Al-Qur'an.
Ilmu Tajwid
Santri mempelajari ilmu tajwid, yaitu kaidah atau hukum tata cara membaca Al-Qur'an. Karena dalam program Binaqu, santri memiliki target mampu menghafal Al-Qur'an 30 juz mut'kin. Oleh karena itu, mempelajari ilmu tajwid bagi santri yang mengikuti program Binaqu wajib, sehingga santri tidak hanya mampu menghafal Qur'an saja, namun juga mampu membaca dengan fasih.
Qiroat sab'ah
Santri diajarkan ilmu tentang 7 cara membaca Al-Qur'an yang sah, bersumber langsung dari Nabi Muhammad SAW melalui sanad mutawatir. Masing-masing bacaan ini dinisbatkan kepada imam ahli qira'ah tertentu, seperti Imam Na'fi, Ibn Khatim, Asim, dan lainnya. Dengan begitu, santri mampu mengenal berbagai macam variasi cara membaca Al-Qur'an.


